2、猪初入发酵床的管理
如果每个发酵床的面积不大，要尽量在单个发酵床栏舍中放同一母猪的仔猪，这样可以避免进入发酵床后不同窝的猪会发生激烈的争斗，如果在一个发酵床实在要放不同母猪下的仔猪，进入发酵床后发生争斗打架是正常现象，这个过程一般会有两天左右的时间，为了减少争斗，可以将白酒喷洒在被咬猪的身体和争强好胜者猪的鼻子上，这样可以大幅减少争斗，但还是不能完全避免。合栏时还要注意大小一致、强弱分群、夜并昼不并等原则。猪进入发酵床后，不要马上饲喂饲料，首先可以给一些青绿饲料，保证饮水器有足够的饮水。猪初到发酵床中是比较兴奋的，要等到猪稍微安静下来后再饲喂饲料，由于刚进发酵床可能会有些不适应影响猪的肠胃功能，因此进入发酵床后前三天，要控制喂量（最好在饲料或饮水中添加启富em菌种保健液），防止过饱引起消化不良，三天后逐渐加料，七天后恢复正常喂量。在高温的夏季，初入发酵床的猪一周左右食量会有所下降是正常现象，这主要一是环境改变需要适应，二是开始会拱食垫料而稍微减少了食量。如果发酵床的第一次使用是在高温的夏季，由于发酵床发酵时间较短可能造成发酵床表面温度过高，造成猪睡卧不安，这时要适当进行对猪体的喷淋次数，开启风扇，保持空气流通，一般一周后即可完全安定下来。
对于个别猪进入发酵床后一直感觉不适，应该将其离开发酵床，过一段时间再进入。进入发酵床的猪不要让其养成固定区域排粪的习惯，可以在入栏前从即将迁入的猪原来栏舍中铲一些猪粪放在发酵床的几个地方，这样猪进入发酵床后发现几个地方都有猪粪，就不会在固定区域排粪了。猪分散排粪后，可以减少之后人工辅助覆粪的工作量。
3、发酵床的日常管理
①经常观察猪粪便情况
尽量不让猪群形成固定地点排泄的习惯，这样有利于微生态垫料分解猪粪尿，因为越是分散的猪粪尿，越好分解利用。这一点与普通的养猪方法需要培养固定地点排泄的方式正好相反。对于过于集中的猪粪，等到尿液渗入垫料，粪便稍干之后将成堆的粪便用工具分散埋好后耙平即可。操作中根据实际情况进行人工辅助。
对于一般性个别猪拉稀现象，可以直接给药，不需要隔离；如果有（细菌性或病毒性）拉稀严重现象的猪，立即采取隔离措施（防止传染其它猪），所以，猪场最好有个隔离舍，并清除其所拉出的粪便，同时在拉稀粪便处洒上生石灰粉（或纯保健液）后将粪便与石灰埋入30厘米深发酵床垫料中，以后石灰粉会自然消失融入垫料中。其实，发酵床养猪特别是采用我们的活力微生态垫料养猪，可以大大减少猪发生腹泻的情况，即使有个别的猪腹泻，也会很快自然好起来。
如果某段时间养殖密度过大，粪便堆积较多，建议适当铲出部分粪便于栏外，但即使是这种情况，劳动强度也是极低的。
②注意观察食槽饲料，尽量做到自由采食
保证猪24小时都能吃到料（或者每餐要喂饱）。否则猪可能会由于饥饿而大量采食发酵好的垫料，尽管猪吃发酵垫料是本方法的主要优点之一，也是本法养猪降低成本的主要途径，但吃垫料也要适量，因为饥饿导致猪过量地翻动垫料会影响垫料的正常发酵和使用寿命。实践证明，使用同样饲料、同样重量分别饲喂传统水泥池与发酵床中的猪，发酵床中的猪增长率提高了10%左右，饲料利用率显著提高。这主要有三个因素导致的结果：一是发酵床中的猪每天都有少量的菌体蛋白补充；二是发酵床中的猪每天由于拱吃垫料中的物质将大量的有益菌补充肠道，消化吸收率显著提高；三是猪每天比较水泥池中的猪心情愉快、健康。
③注意观察垫料数量情况
采用纯锯末做垫料的发酵床，并且按照我们以上技术制作，一般只需要在每批猪出栏后（或每3-4个月）补充极少量的新垫料（约5-10%），或者两批猪出栏后补充一次（6-8个月）。这和其他发酵床技术（或菌种）每个月要补充约10%的新垫料比较有巨大区别。因为发酵后的垫料，也是猪喜爱的一种饲料源，猪本身也有爱拱吃垫料和刨坑吃垫料的习惯，发酵层中不断产生菌体蛋白质，是猪的良好饲料源，特别是以统糠为主的垫料，由于统糠本身猪也爱吃，尽管采用了24小时自由采食的措施，猪还是会吃掉一部分垫料。所以要及时补充。至于为什么猪粪在不断地补充到垫料上不仅不会增加垫料的厚度，反而垫料厚度下降了的原理请看我们后面介绍的详细原理。垫料的厚度主要看季节和养猪密度而定，冬天垫料厚一点，夏天薄一点，因为冬天温度低，发酵强度不大，需要增加垫料厚度来保温和增强发酵力，夏天则正好相反，以北方为例，春秋季节一般在70厘米左右厚度即可，冬天适当增加厚度到80厘米以上，夏天可以在60厘米左右。垫料厚度的控制是人工添加（夏季可以一直不添加新垫料即可），添加的垫料可直接用惰性主原料（最好是锯末），加上清水和保健液菌种（每100公斤锯末需要添加100公斤水 1公斤保健液混匀即可使用）。
④经常注意观察垫料含水量情况
最合理的垫料水份含量是50%左右，其中上层最干，大约应该有30%左右含水量，中间兼性主发酵层应该为50%，下层厌氧发酵层为含水量60%左右，当中下层垫料过干时，只要将1%的保健液水喷洒在垫料表面，由于表层锯末疏松的原因不会怎么吸水，很快就会流到中下层垫料中，这就是为什么垫料表层含水量不会很高的原因。
平时多注意表面层的水份，如果太干，则需要洒上点水，最好是以1%的保健液水（100公斤清水 1公斤保健液），如果阴雨天气发现表层垫料过于湿润，则需要用耙子和铲子进行适当松料，把耙铲插入料中约15厘米左右，抖动几下，如此进行松料操作，目的是让微生态垫料适当松动，以便进入更多的空气，加速发酵产热，蒸发更多的水分，也便于水份从垫料中挥发出来，适当打开卷帘和排风扇进行通风。太湿的情况下，也可以采用掺入新鲜的含水量少的垫料进行中和水份。其实在发酵床实施中造成水分过大的情况是很少出现的。但是，在冬天由于猪舍密封比较好，易引起垫料过湿，因此，要注意在气温较高的中午把窗外或薄膜打开通风以降低舍内湿度。如果湿度已经过大，在冬天直接洒些干木屑在表面并喷洒适量保健液即可，不要加水。
一般来说，高温（平均日气温超过31℃）晴朗的夏天、高温干爽的秋天，每天都要使用100清水（其中加入1公斤保健液）对猪体、栏舍、垫料进行喷淋1次或几次，雨天少喷或不喷。喷淋的最好设备是洗车用的高压清洗机，一般为400元左右一台。春季或雨水湿度较大的天气则根据垫料表面的湿润情况几天、甚至20来天泼洒一次，温度低时不能喷淋猪身，利用直接泼洒在垫料表面即可。
寒冷的冬季，也是根据垫料表面的湿度来决定，一般一周泼洒一次，不能泼洒到猪身，如果是湿度较大的雨水天气，则可以长时间不泼洒。
总之使表面层垫料的含水量保证在干爽而不湿的状态，目测有湿的感觉，含水量大约在30%，但又手感干爽，较松散不板结的样子。这个湿度不会造成对猪不好的影响，也不会让动物有太凉的感觉，反而对猪的健康特别是皮肤的保护非常有帮助，大家看到——以前在水泥池养猪时猪的皮肤上总是有很多难看的红点（猪痘），而在发酵床上的猪是几乎没有皮肤病的，就连认为不能治疗的猪环状病毒到了发酵床上一段时间也自然而愈，整个猪身非常干净自然，看着就让人舒服。
发酵床垫料中水份的循环状况如下：
进入微生态垫料中的水份主要来自猪的排泄，即主要是尿液和粪便中的水份，以及人工喷淋猪身及垫料表面的补充（特别是高温的夏季）。
水份散失主要靠发酵产热，从而把水份蒸发，通过空气对流挥发到空气中，再通过排风排到室外，所以，为了保证垫料中合理的水份含量，应该注意经常观察表面水份状态，一般情况下，只要表面层水份保证在30%左右，下面的兼性主发酵层和底层厌氧发酵层的水份都会是正常的。
⑤启富微生态垫料微生态平衡的维护
这一点，除了根据上面的垫料数量和含水量的维护外，主要靠闻气味（或垫料的PH值，正常的发酵床垫料PH值为5左右，而猪粪的PH值为8.5左右）来诊断发酵床是否处于正常的运行状态。正常运转良好的微生态垫料气味应该清香、有原料味（当然使用越久的垫料，气味越没有原料味，而多了点发酵粪便的气味，但不臭，刚开始使用的垫料还应该有曲香味，如果垫料中有氨味和轻臭味，则说明可能粪便分解不了，排泄的粪尿超过了微生态垫料的消化能力，这时候，有几点可以做：
①需要增加垫料厚度，特别是进入冬天，或气温转冷的天气情况下，靠别的措施无法根本解决问题的情况添加新垫料（加入少量玉米粉）是最有效的；
②添加启富菌种，如添加保健液，可以在垫料表面洒入保健液，也可以翻动垫料，洒入到15厘米以内层中；每平方米洒入1～2公斤高活力保健液；
③翻动垫料层，耙松垫料，以进入更多空气，增强发酵效果，这种做法主要是在经观察垫料比较板结的情况下进行，或垫料水份过高的情况下进行；
④减少猪的饲养密度，这种做法主要是猪进入中大猪阶段，需要进行密度调整的情况下进行；
⑤给垫料增加点营养，如果垫料退化很快，可能说明你的垫料配方不合理，过多的使用了含粗纤维不高的采用，导致垫料很快就被分解，这时应该添加一些较粗的如锯末类的物质。北方在冬天第一批制作微生态垫料时，可能因为温度过低，无法发酵启动，这时，需要使用薄膜 草料覆盖或采取其他升温措施，才能启动发酵进行。或者铺完垫料后就直接进猪，利用猪的体温促进一个局部发酵，逐渐扩展到周围发酵。 一个好的启富微生态垫料，一般一次制作后，可以连续使用三年以上，甚至十年都有可能，垫料如果板结加快，分解粪尿能力下降，可以考虑更换垫料，使用新制作的垫料，更换时，挖出老垫料层上面的30厘米即可，最下层垫料气味正常，甚至有香味，可以留作为菌种源之一，作为下一批垫料制作的菌种源，只要补充上面垫料层即可。在两次使用最下层垫料后，则考虑全部更换垫料。
你也可以考虑将使用几年后的垫料，进行日光曝晒几天，再重新使用，不过重新使用的老垫料只能最多占整个发酵床垫料的一半。
